====== セルイラストレータ 3.0 (旧製品) ====== {{ :ci_logo.jpg}} セルイラストレータは生物システムの描画、モデリング、シミュレーションを可能にしたソフトウェアです。DNAや、mRNAやタンパク質間の相互作用だけでなく、代謝経路、シグナル伝達カスケード、遺伝子制御パスウェイなど複雑な生物システムを直感的かつ手軽に描画、モデリングすることができます。 セルイラストレータを用いることで、あなたが今まで頭の中だけに描いていた生物パスウェイの可視化,実験データの解釈、仮説のテストなどが可能になります。 さらに、印刷、出版に最適な品質で、描画されたモデルやとシミュレーション結果の出力が可能です。 現在、[[lineup|製品ラインナップ]]として以下の五種類のパッケージを提供しています: * セルイラストレータ ドロー * セルイラストレータ スタンダード * セルイラストレータ クラスルーム * セルイラストレータ プロフェッショナル 今回新しくなったセルイラストレータ3.0では以下の[[key_features|機能]]が利用可能になりました: * SBML や CellML フォーマットへの対応 * ベクター形式 (SVG) で作成されたアイコン群 * より強化されたペトリネットエンジン * より便利に、より分かりやすくなったシミュレーションチャート * 外部データベースとの連携 * 遺伝子ネットワークモードによるネットワーク解析 * [[http://www.csml.org/|CSML ウェブ]] より入手可能な数百以上のパスウェイサンプル リリースノート ([[new_version|html]],{{:cireleasenotes.pdf|pdf}}) 学術論文 ([[publications|html]])==== ダウンロード ==== * セルイラストレータ 3.0 ウィンドウズ版 (Java VM なし) を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_w.zip|ダウンロード]] (67 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_w.zip|ミラー]] ]\\ * セルイラストレータ 3.0 ウィンドウズ版 (Java VM あり) を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_wj.zip|ダウンロード]] (90 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_wj.zip|ミラー]] ]\\ * セルイラストレータ 3.0 リナックス版 (Java VM なし) を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_l.bin|ダウンロード]] (56 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_l.bin|ミラー]] ]\\ * セルイラストレータ 3.0 リナックス版 (Java VM あり) を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_lj.bin|ダウンロード]] (85 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_lj.bin|ミラー]] ]\\ * セルイラストレータ 3.0 Mac OS X 版を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_m.tgz|ダウンロード]] (65 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_m.tgz|ミラー]] ]\\ * セルイラストレータ 3.0 Unix 版を[[ftp://ftp.hgc.jp/pub/mirror/Cell_Illustrator/CI3.0_u.jar|ダウンロード]] (56 MB) [ [[http://fqs.pl/download/Cell_Illustrator/CI3.0_u.jar|ミラー]] ]\\ ===== システム要件 ===== * **対応OS** * Windows NT/2000/XP/Vista * Linux * Mac OS X 10.4.8 (Tiger) 以上 * Unix\\ * **ハードウェア** * **推奨要件** \\ CPU: 2 GHz RAM: 1G \\ * **最低要件** \\ CPU: 1 GHz RAM: 512 MB ハードディスク空き容量: 100 MB \\ * **その他** * Java Runtime Environment (JRE) 1.5.0 以上 \\ * Linux および Windows 版においては, Java ランタイム付属、非付属の選択が可能です \\ ===== セルイラストレータ3.0 ドロー/スタンダード/クラスルーム/プロフェッショナル===== * **セルイラストレータ 3.0 ドロー** (ライセンスフリー [[dds|Download]]) \\ シミュレーション機能を省略し、パスウェイの作成に特化した無償版パッケージです。 * **セルイラストレータ 3.0 スタンダード** \\ 専門的で大きなパスウェイモデルは必要ないという方を対象に、プロフェッショナルの機能はそのままにコンパクトにまとめたパッケージです。 * **セルイラストレータ 3.0 クラスルーム** \\ 小規模なパスウェイを対象とした実習での際に最適な低価格パッケージです。大学・専門学校などの教育機関には同等の機能をもつクラスルームエディションもご用意しております。 * **セルイラストレータ 3.0 プロフェッショナル** \\ あらゆる規模のパスウェイモデルの構築に必要なすべての機能を搭載。導入当初から生産的で効率的なワークフローを可能にします。 * **セルイラストレータ 3.0 に関わる製品比較** \\
機能 セルイラストレータ プロフェッショナル セルイラストレータ スタンダード セルイラストレータ クラスルーム セルイラストレータ ドロー
1. パスウェイの表示
(CSMLファイルの読み込み)
O O1 O1 O1
2. パスウェイの作成 O O1 O1 O1
3. パスウェイのシミュレーション O O1 O1 X
4. SBMLファイルのインポート O O O O
5. CellMLファイルのインポート O O O O
6. シミュレーションの結果の保存
(CSV形式)
O O O Δ2
7. エレメントの検索 O O O O
8. シミュレーションできる
パスウェイのサンプル
O O1,3 O1,3 O1,3
9. モデルの印刷 O O O O
10. グラフレイアウト O O O O
11. 遺伝子ネットワークモード
  1. 遺伝子ライブラリ
  2. 遺伝子ネットワークの統合
  3. 経路探索
  4. 発現プロット
  5. 遺伝子ネットワークのサンプルファイル
  6. 酵母の遺伝子ネットワークのデータ
O
O
O
O
O
O
O
O1
O1
O1
O1
O1
O
Δ4
O1
O1
O1
O1
O1
O
Δ4
O1
X1
O1
O1
X1
O
X
  1. 扱えるエンティティの個数に制限あり(30個まで)
  2. 開いたデータにシミュレーション結果のログが含まれている場合に限る
  3. セルイラストレータプレイヤーでサンプルパスウェイの表示とシミュレーションの再生が可能。*すべてのセルイラストレータラインアップに付属するモデル再生専用の無償ライセンスソフトウェア
  4. プロフェッショナル版のネットワークとは異なる(30遺伝子)