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+ | ====== セルイラストレータ 5.0 ====== | ||
+ | {{ :ci_logo.jpg|CI logo}} セルイラストレータは、一般的な生物学の知識をもつ方々にも簡単に生物システムの描画、モデリング、シミュレーションができることを目指し、実現したソフトウェアです。DNA、mRNA やタンパク質間の相互作用だけでなく、代謝経路、シグナル伝達カスケード、遺伝子制御パスウェイなど複雑な生物システムを直感的かつ手軽に描画、モデリングすることができます。 | ||
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+ | セルイラストレータを用いることで、今まで研究者が頭の中だけに描いていた生物パスウェイの可視化、実験データの解釈、仮説のテストなどが可能になります。 作成したモデルやそのシミュレション結果は、画面表示だけではなく、印刷や出版に適当な質の出力が可能です。 | ||
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+ | {{ :apoptosis_large.png?direct&500 |CI 5.0 workspace}} | ||
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+ | ===== 試用できます ===== | ||
+ | * [[https://cionline.hgc.jp/cionlineserver/apps/usersman/main|セルイラストレータオンライン 5.0]] | ||
+ | * [[https://cio.bioillustrator.com/cionlineserver/apps/usersman/main|セルイラストレータオンライン 5.0]] (ライセンス購入をご希望の方) | ||
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+ | 各ウェブサイトの Register ボタンをクリックしてユーザ登録を行います。ユーザ登録後プロフェッショナル版と同等の機能を 2 週間試用することができます。 | ||
+ | プレイヤーは無償で利用できます。[[https://cionline.hgc.jp/cionlineserver/launchCIOPlayer?model=http://www.csml.org/download/model/csml30/circadian_drosophila_30.cil.gz|サンプル]]はこちらからご覧いただけます。 | ||
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+ | ===== 書籍について ===== | ||
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+ | セルイラストレータを使ったパスウェイのモデル化とシミュレーションを行うまでを解説した本があります。 | ||
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+ | * [[http://www.amazon.co.jp/dp/4320056582/|システム生物学がわかる!―セルイラストレータを使ってみよう]] | ||
+ | * [[http://www.amazon.co.jp/dp/1848820224/|Foundations of Systems Biology: Using Cell Illustrator and Pathway Databases (Computational Biology)]] | ||
+ | ===== セルイラストレータ関連のオンライン冊子 ===== | ||
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+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info12.pdf|Infomatics World No.12]] | ||
+ | * システム生物学の勧め 第 1 回 システム生物学のルーツからそのアウトブレイク前夜まで | ||
+ | * “Cell Illustrator”を使ってみよう(1)パスウェイを描く | ||
+ | * 生命システムのモデル作りとシミュレーション ~セルイラストレータを使ってみよう~ | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info13.pdf|Infomatics World No.13]] | ||
+ | * システム生物学の勧め 第 2 回 システム生物学時代の新たな戦い方 | ||
+ | * セルイラストレータを使った生物学研究室との共同研究例 | ||
+ | * “Cell Illustrator”を使ってみよう(2)パスウェイを動かす | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info14.pdf|Infomatics World No.14]] | ||
+ | * システム生物学の勧め 第 3 回 システム生物学で優位に立つためのバイオインフォマティクス戦略 | ||
+ | * Cell Illustrator を用いた神経細胞シミュレーション | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info15.pdf|Infomatics World No.15]] | ||
+ | * “Cell Illustrator”を使ってみよう(3)シミュレーションを楽しむ | ||
+ | * 代謝反応メカニズムをセルイラストレータで再現しよう | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info16.pdf|Infomatics World No.16]] | ||
+ | * システム生物学の勧め 第 4 回 遺伝子ネットワークの地図作りとナビゲーション | ||
+ | * “Cell Illustrator”を使ってみよう(4)遺伝子ネットワークを探索する | ||
+ | * 生物時計の光応答と時差ぼけシミュレーション | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info17.pdf|Infomatics World No.17]] | ||
+ | * Cell Illustratorを用いた遺伝子多重化の効果の解析 | ||
+ | * Cell Illustratorを用いた細胞システム維持に影響する生命パスウェイ重要部位の推定 | ||
+ | * [[http://wako-chem.co.jp/siyaku/journal/infomatic/pdf/info19.pdf|Infomatics World No.19]] | ||
+ | * システム生物学の勧め 第 5 回 遺伝子ネットワークの設計原理: ネットワークモチーフ | ||
+ | * Cell Illustratorを使ってみよう (5)Cell Illustrator Onlineのご紹介 | ||
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+ | ===== ラインナップ ===== | ||
+ | 現在、[[lineup|製品ラインナップ]]として以下の3種類のパッケージを提供しています: | ||
+ | * セルイラストレータ プレイヤー (セルイラストレータオンラインの各ウェブサイトで無償でご利用頂けます) | ||
+ | * セルイラストレータ スタンダード | ||
+ | * セルイラストレータ プロフェッショナル | ||
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+ | * 授業などの期間限定での使用目的のために、クラスルームライセンスを用意しております。別途お問い合わせください。 | ||
+ | * イントラネット内での通信にのみ配慮したサーバ版のライセンスも用意しております。別途お問い合わせください。 |